Antes de seu lançamento, a temática de Missile Command foi considerada muito assustadora para as pessoas. O jogo se chamaria Armageddon (o fim do mundo) e mísseis estariam atacando a California. Como o jogo estava sendo lançado em plena Guerra Fria, algumas coisas foram alteradas.

Em Missile Command um ataque de mísseis está acontecendo a uma cidade e seu objetivo, como responsável pela base anti-mísseis, é proteger a cidade da destruição. O jogador possui munição limitada para passar os níveis, mas seus tiros afetam uma área considerável da tela, possibilitando que o jogador acerte mais de um míssil de uma vez.

Caso o jogo seja iniciado no nível 13 e o jogador dispare todos os seus mísseis sem acertar nenhum alvo, no final do jogo as letras RF (de Rob Fulop) irão aparecer no lugar da ultima cidade na direita. A Atari fez Rob Fulop retirar suas iniciais do jogo, mas não se sabe de nenhum cartucho onde o Easter Egg não exista.

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